Το clinical pilates πρόκειται για μία παραλλαγή του παραδοσιακού pilates,το οποίο στοχεύει εξατομικευμένα σε άτομα με τραυματισμούς , χρόνιο πόνο ή άλλες διαταραχές της υγείας.Σε αντίθεση με ένα παραδοσιακό πρόγραμμα pilates,το οποίο εκτελείται σε ομαδικά γκρουπ,το clinical εκτελείται καθαρά σε ατομικό επίπεδο ή σε μικρά γκρουπ των δύο-τριών ατόμων υπό την επίβλεψη του εξειδικευμένου επαγγελματία υγείας.Τις περισσότερες φορές οι αρχές του clinical pilates εφαρμόζεται στην πλειονότητα των φυσικοθεραπευτικών προγραμμάτων για την αποκατάσταση κάποιου οξέος ή χρόνιου τραυματισμού,πάντοτε με την εξατομίκευση και την ανάλογη προσαρμοστικότητα στις ανάγκες και τις απαιτήσεις του εκάστοτε ασθενή.

Ένα πρόγραμμα clinical pilates είναι σχεδιασμένο να ενεργοποιεί συγκεκριμένες μυικές ομάδες,να βελτιώνει την επίγνωση του σώματος και να ενισχύει την σταθερότητα και το συντονισμό των κινήσεων.Συνήθως οι ασκήσεις περιλαμβάνουν κινήσεις σε συγκεκριμένα εύρη και μυικές συσπάσεις,βασισμένες στο συγχρονισμό αυτών με την αναπνοή.Η χρήση ειδικού εξοπλισμού όπως το κρεβάτι reformer,λάστιχα αντίστασης ή μπάλες ισορροπίας χρησιμοποιούνται αναλόγως με τις ανάγκες και τις δυνατότητες του ασθενή.

To pilates reformer αποτελεί ένα σημαντικό κομμάτι στο θεραπευτικό πρόγραμμα του clinical pilates,καθώς η ποικιλία των ασκήσεων , αλλά και των τροποποιήσεων που μπορούμε να κάνουμε είναι πολύ αποτελεσματική στις ιδιαιτερότητες του εκάστοτε ασκούμενου-ασθενή.Αποτελείται από ένα σκελετό ξύλινης κατασκευής,μέσα στον οποίο βρίσκεται μία κινούμενη πλατφόρμα στην οποία ο ασκούμενος εκτελεί το ενδεδειγμένο πρόγραμμα.Η πλατφόρμα αυτή(βαγόνι) έχει λαβές στις οποίες τοποθετούνται ελατήρια αντίστασης προκειμένου να δώσουμε διαβάθμιση δυσκολίας.

Το clinical pilates επομένως έχει κάποια χαρακτηριστικά,τα οποία το διακρίνουν από τα υπόλοιπα είδη άσκησης λόγω της:

1. Εξατομικευμένης αξιολόγησης: Πριν από την έναρξη του clinical pilates, διενεργείται συνήθως μια διεξοδική αξιολόγηση του ιστορικού, της φυσικής κατάστασης και συγκεκριμένων θεμάτων του ατόμου. Αυτή η αξιολόγηση βοηθά στο σχεδιασμό ενός προσαρμοσμένου προγράμματος άσκησης.
2. Στοχευμένης άσκησης: Το Clinical Pilates χρησιμοποιεί ασκήσεις βασισμένες στις αρχές του Pilates,οι οποίες τροποποιούνται ή προσαρμόζονται για να καλύπτουν τις ατομικές  ανάγκες του ασθενή. Αυτό μπορεί να περιλαμβάνει τη χρήση εξειδικευμένου εξοπλισμού, όπως reformers,λάστιχα αντίστασης ή διάφορες επιφάνιες ισορροπίας με σκοπό την αύξηση δυσκολίας του προγράμματος.
3. Εστίασης στη δύναμη του κορμού: Όπως το παραδοσιακό Pilates, έτσι και  το clinical δίνει μεγάλη έμφαση στην ανάπτυξη της δύναμης του κορμού, η οποία μπορεί να βοηθήσει στη μείωση του πόνου , στη σταθερότητα και στον συνολικό έλεγχο του σώματος.
4. Αποκατάστασης: Το Clinical Pilates χρησιμοποιείται συχνά σε προγράμματα αποκατάστασης για να βοηθήσει τον ασθενή να αναρρώσει από τραυματισμούς ή χειρουργικές επεμβάσεις.
5. Διαχείρισης πόνου: Όπως κάθε είδος θεραπευτικής άσκησης μπορεί να είναι ευεργετική για άτομα με χρόνιες καταστάσεις πόνου, όπως στη μέση,τον αυχένα,γενικότερα σε πόνους των αρθρώσεων ,αλλά και σε πόνους συστηματικών παθήσεων, καθώς βοηθά στη βελτίωση της στάσης , της ισορροπίας , της δύναμης και της επίγνωσης του σώματος.

Με λίγα λόγια το clinical pilates αποτελεί την πιο ασφαλή και αποτελεσματική μέθοδο άσκησης,λόγω της εξατομίκευσης,του περιορισμένου αριθμού συμμετοχόντων και της παρουσίας του εξειδικευμένου επαγγελματία υγείας,ο οποίος διασφαλίζει ότι το ασκησιολόγιο θα είναι το κατάλληλο για τον ασθενή-ασκούμενο του.