Υπάρχει μία αντίληψη ότι η φυσικοθεραπεία είναι μία θεραπευτική μέθοδος, η οποία μπορεί μερικές φορές να είναι επώδυνη. Αυτό αποτελεί μία λανθασμένη αντίληψη, δεδομένου ότι οι περιπτώσεις στις οποίες ο πόνος εξαλείφεται με πόνο, είναι ελάχιστες.
Ο πόνος είναι συνδυασμός σωματικών και συναισθηματικών διεργασιών και η εφαρμογή επιπρόσθετου πόνου μέσω των φυσικοθεραπευτικών μεθόδων θα καθυστερούσε τη διαδικασία επούλωσης και την αποκατάσταση της υγείας.
Εξαίρεση αποτελούν ορισμένα περιστατικά μετεγχειριτκής αποκατάστασης, όπου σημειώνεται περιορισμός της αρθρικής κίνησης. Στην προκειμένη περίπτωση η ανεκτή για τον ασθενή ενόχληση σχετίζεται με την εξάλειψη της δυσκαμψίας και την αποκατάσταση αυτής.